协议离婚后，才发现男方是有了小三，还能起诉吗

可以的。当事人在婚姻登记机关办理离婚登记手续后，以婚姻法第四十六条规定为由向人民法院提出损害赔偿请求的，人民法院应当受理。

根据《中华人民共和国婚姻法》规定：

第四十六条有下列情形之一，导致离婚的，无过错方有权请求损害赔偿：

（一）重婚的；

（二）有配偶者与他人同居的；

（三）实施家庭暴力的；

（四）虐待、遗弃家庭成员的。

根据最高人民法院关于适用《中华人民共和国婚姻法》若干问题的解释（法释〔2001〕30号）：

第二十九条 承担婚姻法第四十六条规定的损害赔偿责任的主体，为离婚诉讼当事人中无过错方的配偶。

人民法院判决不准离婚的案件，对于当事人基于婚姻法第四十六条提出的损害赔偿请求，不予支持。

在婚姻关系存续期间，当事人不起诉离婚而单独依据该条规定提起损害赔偿请求的，人民法院不予受理。

第三十条 人民法院受理离婚案件时，应当将婚姻法第四十六条等规定中当事人的有关权利义务，书面告知当事人。在适用婚姻法第四十六条时，应当区分以下不同情况：

（一）符合婚姻法第四十六条规定的无过错方作为原告基于该条规定向人民法院提起损害赔偿请求的，必须在离婚诉讼的同时提出。

（二）符合婚姻法第四十六条规定的无过错方作为被告的离婚诉讼案件，如果被告不同意离婚也不基于该条规定提起损害赔偿请求的，可以在离婚后一年内就此单独提起诉讼。

（三）无过错方作为被告的离婚诉讼案件，一审时被告未基于婚姻法第四十六条规定提出损害赔偿请求，二审期间提出的，人民法院应当进行调解，调解不成的，告知当事人在离婚后一年内另行起诉。

最高人民法院关于适用《中华人民共和国婚姻法》若干问题的解释(二)（法释[2003]19号）规定：

第二十七条当事人在婚姻登记机关办理离婚登记手续后，以婚姻法第四十六条规定为由向人民法院提出损害赔偿请求的，人民法院应当受理。但当事人在协议离婚时已经明确表示放弃该项请求，或者在办理离婚登记手续一年后提出的，不予支持。

可以起诉。但最多可以在财产分割上进行重新分配。

只是小三是不适用《婚姻法》第四十六条的。必须他们在你们婚姻存续期间是以夫妻名义共同生活，才能涉嫌触犯第四十六条第一款:重婚罪。

双方在离婚后一年内，如果对双方在离婚时的财产分割情况反悔的，可以进行起诉要求重新分割财产。但是，该案例的当事人发现另一方出轨，应该不能作为重新分割财产的理由。因为，根据《婚姻法》及相关司法解释，男女双方协议离婚后一年内就财产分割问题反悔，请求变更或者撤销财产分割协议的，人民法院应当受理。人民法院审理后，未发现订立财产分割协议时存在欺诈、胁迫等情形的，应当依法驳回当事人的诉讼请求。

即双方协议离婚的，且对于财产分割问题进行协议的，如对该分割协议反悔，认为存在欺诈、胁迫等影响真实意思表示的情况，则可以在协议离婚后一年内提出，可请求人民法院予以对离婚协议变更或者撤销。

另外，根据《婚姻法解释三》第十八条规定，离婚后，一方以尚有夫妻共同财产未处理为由向人民法院起诉请求分割的，经审查该财产确属离婚时未涉及的夫妻共同财产，人民法院应当依法予以分割。